企业是自主创新的主体，制度环境是自主创新的保障。我省企业自主创新取得长足进步，其中关键就是省委、省政府高度重视，各有关部门着力落实好财政科技投入的稳定增长机制，引导、支持和提升企业的自主创新能力，进一步强化企业技术创新主体地位，推动“福建制造”迈向“福建创造”。

特别是企业研发费用税前抵扣——这项激励自主创新的科技政策三年来结出一个个硕果，惠及省内近2000家科技型企业。来自税务部门刚刚出炉的统计数字，2010年度我省“企业研发费用税前抵扣”政策共为全省企业加计扣除额为19.32亿元，同比增长40.7%；而2009年，在2008年增长74.13%的基础上再增长23.6％，三年内年均增长45%以上，引导企业加强技术创新效应持续彰显。据统计，仅2008年至2010年3年间，这项政策为全省企业加计扣除研发费用多达44.16元。其中，2010年度全省高新技术企业所得税减免19.3亿元，同比增长73.8%，通过科技创新政策作用，形成创新投入—政策支持—再创新投入的良性循环，科技创新政策“杠杆效应”逐渐凸显。